Caracterización molecular de ‘Candidatus Phytoplasma asteris’ y un aislado de Bean golden yellow mosaic virus presentes en infección mixta en frijol común en Cuba

Resumen

Se llevaron a cabo encuestas en Cuba durante octubre a marzo de 2011 a 2013, con observaciones de una mezcla de síntomas similares a los asociados con las infecciones por fitoplasmas y begomovirus en campos de frijol común (Phaseolus vulgaris L.) de las provincias La Habana y Mayabeque. El ADN total se extrajo de 99 plantas sintomáticas y diez asintomáticas; se utilizaron como moldes en un PCR anidado para detectar fitoplasmas, utilizando cebadores universales que flanquean al gen del ARNr16S, así como de un PCR para amplificar la región N-terminal de la proteína Rep de los begomovirus, la región intergénica y región N-terminal de la proteína de la cápsida. Tanto las secuencias de fitoplasma como del begomovirus obtenidas, se compararon con las de referencia en el GenBank por BLASTn. Del total de muestras colectadas, el 72,72 % fue positivo a estas infecciones. En el 11,11 % se detectó fitoplasma, en el 17,17 % begomovirus y 44 % presentó infecciones mixtas de ambos patógenos. Los análisis de RFLP y filogenia confirmaron la identificación del fitoplasma como miembro del grupo 16SrI 'Candidatus Phytoplasma asteris', subgrupo 16SrI-B. El análisis de secuencia reveló que el begomovirus coexistiendo con el fitoplasma 16SrI, en plantas de frijol común, era el virus del mosaico dorado del frijol (BGYMV). El aislado BGYMV actual mostró 98 % de similitud en la secuencia de componentes A con la de un aislado anterior de BGYMV de Cuba (AJ544531), y su componente B estaba estrechamente relacionado con el del clado del aislado estadounidense BGYMV-US (DQ119825).