Diversidad genética de aislados de Ralstonia solanacearum procedentes de tres regiones de Colombia

Resumen

Este trabajo se realizó con el objetivo de analizar la diversidad genética del complejo de especies Ralstonia solanacearum en tres regiones de Colombia donde se siembran cultivos hospedantes de gran importancia económica para el país. Se colectaron 69 aislamientos procedentes de suelo y diferentes hospedantes. Para determinar la diversidad genética entre los aislados se utilizaron los marcadores moleculares del tipo microsatélite amplificados al azar (RAMs). Los datos se analizaron utilizando el coeficiente de Nei-Li, el análisis de correspondencia múltiple (ACM) y el índice de Shannon. Los valores del coeficiente de Nei-Li, a un nivel de similaridad de 0,76%, permitieron agrupar los aislamientos en tres divisiones. El ACM arrojó un valor de similitud del 67% al interior de 10 grupos y del 62% entre los grupos. El Coeficiente de diferenciación genética (Gst) mostró un valor de 0,13 e indicó que existe mayor diversidad genética de los aislados dentro de cada grupo que cuando se comparan los diferentes grupos entre sí. El valor del índice de Shannon corresponde con los otros índices y muestra que los aislados en cada grupo presentan una diversidad mayor que la que existe entre los grupos. La interpretación del valor de Gst interpoblacional (0,0514) sugiere una diferenciación genética moderada de la población. Los resultados indican o señalan alto flujo de genes entre las poblaciones.

Palabras clave: Ralstonia solanacearum, diversidad genética, RAMs.

Genetic diversity of Ralstonia solanacearum isolates from three Colombian regions

Abstract: The present work was performed to analyze the genetic diversity of the R. solanacearum species complex in three Colombian regions where economically important host crops are grown. Sixty nine isolates were collected from different hosts and soils. The genetic diversity was determined using Random Amplified Microsatellites (RAMs) as molecular markers . The data were analyzed by the  Nei and Li coefficient, Multiple Correspondence Analysis (MCA), and the Shannon index. The Nei and LI coefficient values found at a similarity level of 0.76% allowed grouping the isolates into three major divisions.. The MCA showed a similarity coefficient of 67% within 10 groups and 62% between groups. The Genetic differentiation coefficient (Gst) showed a value of 0.13 indicating that the genetic diversity was higher within each group of isolates than when the different groups were compared one another. The Shannon index value corresponded with the other calculated indices, indicating that the isolates within each group showed a higher genetic diversity than that  observed between the different groups. The Inter-population Gst value (0.0514) suggested a moderate genetic differentiation in the population. The results suggested a high gene flow between populations.

Key words: Ralstonia solanacearum, genetic diversity, RAMs.