Genetic variability characterization of rice pathogenic strains of Pseudomonas spp.
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Abstract
The objective of this work was to characterize the genetic variability of strains of Pseudomonas spp. that cause Sheath Brown Rot of rice in Cuba, through the analysis of genomic regions. A first grouping was performed based on the genetic fingerprint analysis by PCR, and then the analysis was developed through rep-PCR (ERIC, BOX and REP-PCR). In the two types of tests, the strains showed molecular variability, which was evidenced by the formation of three groups of Pseudomonas that circulate in the country. One of them grouped the strains A74 and A75, the second group included the strains A90 and A91, and the last group related most of the strains (A9, A36, A63, PR1 and PR3), the latter identified as Pseudomonas sp. or Pseudomonas fluorescens.
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